村田良庵在适塾里学了三四年,回到了家乡,正式继承了父亲的衣钵,成为一名乡村医生,之后,又跟邻村的一个叫琴子的姑娘结了婚。
医生的生涯持续了差不多3年。在这3年里,村田良庵受到了来自各方面的差评。因为他的医术实在是太烂了,治个发烧感冒都玄,若是碰上大一点的毛病给他治,那基本上就算是宣告患者提前死亡了。所以村子里的人对其纷纷摇头,说得最多的一句话就是:“这家伙在大阪到底学了些什么玩意儿啊?”
嘉永六年(1853年),庸医良庵终于熬出了头。倒不是说他得到了李时珍、扁鹊之类的托梦,然后变成了神医,而是黑船开到了日本海,打破了国门,一时间,懂得洋务的人才大为吃香,村田良庵被宇和岛藩的藩主伊达宗城聘请过去担任西洋兵学和兰学的翻译指导。在随后的10年里,他辗转江户、长崎等地,代表幕府传授兰学知识。作为一个洋务人才,他受到了来自各方面的好评。
文久三年(1863年),村田良庵回到了家乡长州,担任洋学堂博习所的讲师。在那里,他认识了高杉晋作。第一次见面的时候,高杉晋作对于这位归国人才并没有表现出什么特别的尊敬,而是大少爷脾气又上来了,当场就给人家起了个外号,叫“吹火达摩”,意思是说,村田良庵的脸看起来很像鼓起嘴巴吹火的达摩祖师爷。这种模样的脸还有专门的面具,一般出现在日本传统的滑稽剧目里,用于搞笑。