《三国志·吴书·吴主传》记载：“公（曹操）烧其余船引退，士卒饥疫，死者大半。”当时，孙吴联军打败曹军，曹操被迫烧掉剩余的船只撤退，撤退途中大量士卒又因为粮食短缺和瘟疫等，导致死亡士卒超过半数。《三国志·魏书·蒋志传》又写道：“时大军征荆州，遇疾疫”，说明瘟疫流传不仅在军队中，而且遍及整个荆州地区。赤壁之战第二年，公元209年，《三国志·魏书·武帝纪》又记载道：“自顷已来，军数征行，或遇疫气，吏士死亡不归，家室怨旷，百姓流离。”
由于赤壁之战恰逢汉末三国大乱世，剧烈的战争死亡、饥荒和瘟疫处处横行，这也成为曹操败北，最终奠定三国鼎立基础的历史背景。
4
从宏观的瘟疫史来看，随着大规模战争的持续爆发，加上西汉凿空西域以后对外交流的扩大，因此，从春秋战国到秦汉、魏晋南北朝时期，中国开始进入了一个瘟疫越来越频繁的快速发展期。
